황궁우는 대한제국기 고종황제가 하늘에 제사를 지낸 환구단의 부속건물입니다.
천자가 하늘에 제사를 지내는 곳인 환구단은 고종이 대한제국의 황제로 즉위한 1897년에 함께 조성 되었고, 황궁우는 2년 뒤인 1899년 환구단의 북쪽에 건립되었습니다.
황궁우는 대한제국의 정통성을 뒷받침해줄 하늘과 땅, 조상신의 신위를 보관하던 공간이었습니다.
환구단은 조선철도호텔이 건립되기 전인 1913년 철거되었으나, 황구우는 현재까지도 남아있습니다.